昌吉第一大學是昌吉大學，排名第二的是昌吉職業(yè)技術(shù)學院，排名第三的是新疆農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學院，以下為具體名單，以供參考。

1、昌吉大學

昌吉大學位于新疆維吾爾自治區(qū)昌吉市，是一所區(qū)屬普通高等學校。學校前身是創(chuàng)建于1959年的昌吉師范學校，2001年5月，升格為昌吉學院。

學校與山東大學、陜西師范大學、吉林大學、廈門大學、北京林業(yè)大學、蘭州大學、中國石油大學（華東）建立長期對口支援關(guān)系，并與山東大學、陜西師范大學、廈門大學聯(lián)合培養(yǎng)本科生和研究生。

2、昌吉職業(yè)技術(shù)學院

新疆昌吉職業(yè)技術(shù)學院是經(jīng)教育部批準設立的公辦全日制普通高等職業(yè)院校，學院是新疆首批“示范性高職院?！?，是經(jīng)新疆維吾爾自治區(qū)教育廳批準的具有自主招生資格的高職（?？疲┰盒Ｖ?。2017年8月，學院入選教育部第二批現(xiàn)代學徒制試點單位。

學院是自治區(qū)首批高職院校示范校之一、自治區(qū)技術(shù)教育聯(lián)盟首屆主席單位、自治區(qū)優(yōu)質(zhì)高等職業(yè)學校建設項目單位，榮獲“全國職業(yè)教育先進單位”稱號、首批國家高技能人才培養(yǎng)基地之一、“全國十佳辦學單位”、“中國校園文化建設示范學校100強”、“自治區(qū)新疆開發(fā)建設證書”、“自治區(qū)文明單位”、“自治區(qū)職業(yè)培訓先進單位”、“自治區(qū)就業(yè)工作先進單位”、“自治區(qū)文明單位”、“自治區(qū)依法辦學示范學?！?、“自治區(qū)模范職工之家”、“自治區(qū)普通高校就業(yè)指導工作督導評估優(yōu)秀單位”、“自治區(qū)大學生思想政治教育優(yōu)秀單位”、“昌吉州先進學?！?、“昌吉州民族團結(jié)進步先進集體”等一系列榮譽。

3、新疆農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學院

新疆農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學院位于新疆昌吉市，是一所舉辦高等職業(yè)教育的公辦全日制普通高等學校，學院是國家示范性高職院校，是新疆“高職教育與本科教育聯(lián)合培養(yǎng)應用型本科人才”試點高校、現(xiàn)代學徒制試點單位、全國職業(yè)教育先進單位、具有典型畢業(yè)生就業(yè)經(jīng)歷的全國性大學，對口支持伊犁職業(yè)技術(shù)學院建設。

新疆農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學院前身是創(chuàng)建于1958年2月的昌吉州合作干部學校，1959年9月，自治區(qū)人民委員會批準改制為新疆維吾爾自治區(qū)昌吉農(nóng)業(yè)技術(shù)學校。1962年4月，更名為新疆維吾爾自治區(qū)昌吉農(nóng)業(yè)學校。1988年2月，更名為新疆維吾爾自治區(qū)農(nóng)業(yè)學校，2000年6月，新疆維吾爾自治區(qū)人民政府批準升格為新疆農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學院。2008年8月，新疆農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學院并入新疆維吾爾自治區(qū)農(nóng)業(yè)干部學校，新疆農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學院（新疆農(nóng)業(yè)技師進修學院）成立。